بررسی الگوی بیان micrornaهای آفتابگردان و ژن های هدف آن ها تحت تنش گرما
thesis
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهرکرد - دانشکده کشاورزی
- author ریحانه ابراهیمی خاک سفیدی
- adviser بهروز شیران اسماعیل ابراهیمی
- Number of pages: First 15 pages
- publication year 1392
abstract
micrornaها یا mirna ها، rnaهایی کوچک به طول تقریبی 21-22 نوکلئوتید هستند که توسط ژنوم موجود کد شده، هیچ نوع پروتئینی را کد نمی کنند و به عنوان تنظیم کننده های مهم بیان ژن پس از رونویسی در گیاهان و جانوران شناخته شده اند. آن ها از طریق تنظیم منفی ژن های هدف خود، قابلیت تغییر الگوی بیان ژن را در بسیاری از شبکه های رشد، نمو و پاسخ به تنش در گیاهان دارند. آفتابگردان (helianthus annuus l.) گیاهی دیپلوئید، یکساله و از تیره (compositae) است. آفتابگردان یکی از گیاهان دانه روغنی است که زراعت آن در سراسر دنیا از جمله کشور ایران رایج است، این گیاه با اختصاص دادن بیش از 22 میلیون هکتار از اراضی جهان به خود به عنوان چهارمین گیاهی روغنی مهم تجاری دنیا، پس از سویا، نخل و کانولا شناخته می شود .تغییرات آب و هوایی بر محصولات زراعی تاثیر منفی می گذارد و میزان تولید را بطور چشمگیری کاهش می دهد. دمای جهانی در قرن بیستم به میزان تقریبی 0/5 درجه سانتی گراد افزایش یافته و پیش بینی می شود که تا سال 2100 این میزان به 1/8تا 4/5 درجه سانتی گراد برسد. دما یکی از فاکتورهای مهم آب و هوایی موثر بر تولید محصولات کشاورزی بوده و دمای بالا اثر نامساعدی بر رشد، نمو و عملکرد گیاهان زراعی می گذارد به گونه ای که عملکرد محصولات زراعی به طور تقریبی به ازای افزایش 1 درجه دما 10% کاهش می یابد. در این پژوهش الگوی بیان تعداد هشت mirna (mir160،mir167 ،mir172 ،mir398 ،mir403 ،mir408 ، mir426، mir842) و ژن های هدف آن-ها (qhg18j04.yg.ab1، arf6، cox5b، nttg5b، ago2، ton1b ،tpp2 و f26k24.21) در بافت برگ و ریشه گیاه آفتابگردان زراعی در شرایط کنترل و تحت تنش گرما با دمای 42 درجه سانتی گراد در زمان-های 1/5، 3 و 6 ساعت با استفاده از روش qrt-pcrبررسی گردید. به منظور اطمینان از تنش وارده به گیاهان اندازه گیری میزان پرولین و بررسی بیان ژن hsp70 به ترتیب، به عنوان معیار های فیزیولوژیکی و مولکولی مورد ارزیابی قرار گرفتند. افزایش چشمگیر میزان پرولین در بافت های برگ و ریشه و افزایش بیان ژن hsp70 در بافت حساس ریشه، دمای انتخاب شده برای انجام تنش را مورد تایید قرار دادند. نتایج حاصل از بررسی بیان mirnaها، الگو های متفاوت بیانی را در دو بافت برگ و ریشه و در خلال تنش های ملایم، متوسط و شدید گرما نشان داد. این تغییرات بیانی متفاوت در بافت های برگ و ریشه و در زمان های مختلف تنش می تواند بیانگر جابه جایی سیگنال های القا شده پس از تنش گرما به بافت برگ و ریشه رخ داده باشد. اغلب mirnaها در بافت برگ و ریشه پس از اعمال تنش 1/5 ساعت افزایش بیان نشان دادند و با طولانی تر شدن مدت زمان تنش میزان بیان آن ها کاهش یافت. بیان mir398 و mir408 در بافت ریشه، روند مشابهی را در تمامی ساعات تنش نشان دادند و بیان mir842 در بافت ریشه پس از قرار گرفتن در دمای 42 درجه سانتی گراد کاهش نشان داد. روند بیان رونوشت ژن های هدف qhg18j04.yg.ab1، cox5b، ntgb5، ago2، ton1b و tpp2 در بافت برگ و ریشه پس از قرار گرفتن در دمای 42 درجه سانتی گراد در مدت زمان 1/5، 3 و 6 ساعت روندی متناوب را از خود نشان دادند و بیان ژن های arf6 و f26k24.21 در زمان های تنش متوسط و شدید در بافت برگ و ریشه کاهش بیان نشان دادند. تغییرات بیانی mirnaها در هر زمان از تنش متغیر بود و روند بیان آن ها با ژن های هدف خود در اغلب موارد روندی ناهماهنگ نشان داد که می تواند بدلیل تفاوت مابین سلول هدف و سلولی که mirna در آن بیان می شود، بوده باشد که این موضوع بیان گر پیچیده بودن شبکه تنظیمی mirnaها می باشد.
similar resources
بررسی الگوی بیان microrna ها و ژن های هدف آن ها در واکنش به تنش شوری در گیاه آفتابگردان
سلول های گیاهی جهت درک سیگنال های مختلف موجود در محیط پیرامونشان نمو یافته اند و از طریق تعدیل بیان ژن ها به آن ها پاسخ می دهند. شناخت مکانیسم های دخیل در تنش های غیرزیستی بسیار حائز اهمیت است. micrornaها یا mirnaها، rnaهای کوچک به طول تقریبی22-21 نوکلئوتید هستند که توسط ژنوم موجود کد شده، هیچ پروتئینی را کد نمی کنند و به عنوان تنظیم کننده های مهم بیان ژن پس از رونویسی در گیاهان و جانوران شناخت...
15 صفحه اولبررسی بیان microrna ها و ژنهای هدف آنها تحت تنش کادمیوم در آفتابگردان
چکیده آلودگی با فلزات سنگین یکی از مشکلات عمده محیط زیست است. کادمیوم یکی از فراوانترین و گسترده ترین آلایند ها می باشد که خطر جدی برای همه موجودات زنده از جمله گیاهان بشمار می رود. پاسخ گیاهان به تنش فلزات سنگین نیازمند تنظیم ژن ها در دو سطح رونویسی و پس از رونویسی می باشد microrna . ها (mirna ها) از دسته rnaهای کوچک با حدود 24-20 نوکلئوتید طول هستند که هیچ پروتئینی را کد نمی کنند و یکی از مه...
بررسی الگوی بیان ژن ویژه تیپ سلولی در جلبک Volvox carteri تحت شرایط تنش نوری
طول موجهای UV-B عمیقتر از هر طول موج دیگری به آب نفوذ میکنند. موجودات یوکاریوتی پیچیده از طریق بیان انتخابی بخش ویژهای از ژنوم یکسان در انواع مختلف سلول، در پاسخ به نشانههای نموی و محیطی از قبیلUV-B تکامل یافتهاند. تشکیل موجودات پرسلولی به مسیرهای سیگنالینگ ژنتیکی از پیش تعریف شده در انواع مختلف سلول نیاز دارد. انواع مختلف سلول باید بتوانند پاسخهای سازشی مناسب را نسبت به محیط در حال تغی...
full textشناسایی و بررسی micrornaهای درگیر در تنش خشکی و ژنهای هدف آنها در گیاه آفتابگردان
micrornaها مولکولهایی با طول تقریبی 21 نوکلئوتید هستند که هیچ پروتئینی را کد نمیکنند و دارای نقشهای بسیار مهمی در تنظیم بیان پس از رونویسی میباشند. اگرچه تا به حال تعداد بسیار زیادی microrna کشف شده، اما پیدا کردن عملکرد مشخص برای آنها هنوز یک چالش اساسی است. تنش غیرزیستی یکی از مهمترین عوامل کاهش محصول سالیانه در دنیا میباشد. تا به امروز تلاشهای بسیاری در جهت کشف و توضیح مکانیسمهای پاسخ به تنش...
15 صفحه اولگروه بندی و بررسی الگوی بیان ژن های خانواده bZIP در ریشه گیاه گوجه فرنگی تحت تنش دمای پایین
Transcription factors (TFs) are master regulators that control gene clusters Plant bZIP (basic region/leucine zipper) transcription factors play crucial roles in biological processes. The Tomato genome sequence contains 73 genes of bZIP transcription factors. The bZIPs in tomato have never been classified. In this study, 73 genes of bZIP transcription factors were classified in 11 groups by th...
full textتاثیر تنش گرما بر تغییرات بیانیmiR398 در گیاه افتابگردان
microRNAها، RNAهایی کوچک به طول تقریبی 21-22 نوکلئوتید هستند که توسط ژنوم موجود کد شده، هیچ نوع پروتئینی را کد نمیکنند و به عنوان تنظیم کننده¬های منفی بیان ژن در مرحله پس از رونویسی در گیاهان و جانوران شناخته شده¬اند. دما یکی از مهم¬ترین فاکتورهای آب و هوایی موثر بر کشاورزی محسوب می¬شود و دمای بالا اثرات نامساعدی بر رشد، نمو و عملکرد محصولات زراعی گیاهان می¬گذارد. در این پژوهش الگوی بیانmiR398...
full textMy Resources
document type: thesis
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهرکرد - دانشکده کشاورزی
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023